11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4622 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  32.39 
 
 		 571 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1123 aa  72  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  29.78 
 
 		 591 aa  71.6  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  31.25 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  33.63 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  30.58 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  32.74 
 
 		 380 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1152 aa  62  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 480 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  31 
 
 		 746 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>