50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1972 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  100 
 
 
92 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  86.81 
 
 
92 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  45.35 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  33.72 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  31.4 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13710  prevent-host-death family protein  37.65 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000922616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2330  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2468  prevent-host-death family protein  41.79 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2783  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.686877 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0751  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  30.12 
 
 
93 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2209  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  unclonable  0.0000000000598277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  25.32 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3875  prevent-host-death family protein  36.71 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0291  hypothetical protein  32.5 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4491  prevent-host-death family protein  35.56 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0628  prevent-host-death family protein  32.91 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000258599  unclonable  0.0000000000739074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0648  prevent-host-death family protein  32.91 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000197099  unclonable  0.0000000000981851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  30.95 
 
 
93 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  29.11 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  31.4 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  35.82 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  25.64 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1954  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  30.49 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  29.27 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  30.23 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  28.05 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  30.49 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  28.21 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  28.21 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  28 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  28.24 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  26.25 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  30.49 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2255  prevent-host-death family protein  25 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  25.3 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0867  prevent-host-death family protein  29.63 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0951251 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0512  toxin-antitoxin system, antitoxin component, PHD family  33.33 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0495  hypothetical protein  36.67 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.671507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  26.39 
 
 
89 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0396  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
86 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2194  prevent-host-death family protein  23.81 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2220  prevent-host-death family protein  29.41 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  29.41 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  27.06 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  26.25 
 
 
91 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>