14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0217 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  26.47 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  32.26 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  32.31 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  27.83 
 
 
146 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  29.66 
 
 
146 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  32.18 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  25.93 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  29.41 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2069  conserved hypothetical protein  45.61 
 
 
242 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0526959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  27.36 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  28.28 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  27.78 
 
 
137 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>