23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3681 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  41.18 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  32.58 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  37.78 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  30.51 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2626  hypothetical protein  39.42 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  37.5 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  28.08 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  35.4 
 
 		 124 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  29.48 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  32.68 
 
 		 163 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2795  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.308254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  33.94 
 
 		 138 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  28.04 
 
 		 185 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  31.48 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  31.68 
 
 		 173 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3366  hypothetical protein  36.62 
 
 		 88 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  32.11 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  36.94 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2496  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  35.14 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0128  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281023  normal  0.647835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>