31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3670 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  60.45 
 
 		 847 aa  1008    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  62.01 
 
 		 847 aa  996    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 851 aa  1724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  57.52 
 
 		 850 aa  947    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  35.33 
 
 		 822 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  35.89 
 
 		 835 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  35.09 
 
 		 830 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  35.38 
 
 		 831 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  32.67 
 
 		 826 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  33.7 
 
 		 841 aa  360  7e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  35.69 
 
 		 825 aa  358  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  33.33 
 
 		 830 aa  351  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  34.81 
 
 		 789 aa  351  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  31.87 
 
 		 823 aa  347  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  31.19 
 
 		 829 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  33.02 
 
 		 814 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  31.67 
 
 		 845 aa  323  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  34.72 
 
 		 846 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  31.62 
 
 		 849 aa  321  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  33.6 
 
 		 835 aa  312  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  29.48 
 
 		 847 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  29.36 
 
 		 847 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  39.79 
 
 		 376 aa  250  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  27.44 
 
 		 472 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  23.56 
 
 		 712 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  26.92 
 
 		 570 aa  77  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  20.47 
 
 		 821 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  25.68 
 
 		 872 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  22.42 
 
 		 869 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  33.33 
 
 		 795 aa  44.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.13 
 
 		 827 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>