16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2945 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2945  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  271  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.718496  normal  0.0382051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62430  hypothetical protein  34.21 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5434  hypothetical protein  32.73 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  31.65 
 
 		 554 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 		 505 aa  47  0.00009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  33.77 
 
 		 530 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  27.66 
 
 		 399 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  29 
 
 		 526 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  29.41 
 
 		 508 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.32 
 
 		 995 aa  43.9  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.63 
 
 		 853 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3821  hypothetical protein  27.66 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 501 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  32.88 
 
 		 531 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  28.26 
 
 		 535 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.48 
 
 		 844 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>