16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2493 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2493  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 436 aa  810    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0697139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1689  polysaccharide biosynthesis protein  32.92 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.64 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  30.39 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 		 449 aa  136  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1505  hypothetical protein  31.31 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  29.98 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0713  polysaccharide biosynthesis protein  31.52 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02808  hypothetical protein  31.23 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000016091  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6369  polysaccharide biosynthesis protein  28.54 
 
 		 429 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 501 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2610  polysaccharide biosynthesis protein  32.2 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>