More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30630  malic enzyme  100 
 
 		 396 aa  788    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3977  malate dehydrogenase  77.66 
 
 		 391 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3991  malate dehydrogenase  77.66 
 
 		 391 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122747  normal  0.205066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4051  malate dehydrogenase  77.66 
 
 		 391 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal  0.971942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4481  malate dehydrogenase  75.88 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.437151  normal  0.103814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6279  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  75.72 
 
 		 392 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.69879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0588  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  73.17 
 
 		 405 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  65.1 
 
 		 386 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  60.51 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3994  malate dehydrogenase  69.75 
 
 		 404 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4173  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.23 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  63.73 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.46 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  62.76 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3685  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  62.95 
 
 		 395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3773  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  70.57 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2214  malate dehydrogenase  76.32 
 
 		 316 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  60.65 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7700  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  65.25 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474841  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1419  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  63.64 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3695  malate dehydrogenase  64.55 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.669073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  60.32 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4075  malate dehydrogenase  62.67 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0926309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3751  malate dehydrogenase  61.84 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.131564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  54.43 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  52.44 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  52.14 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  53.35 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  53.08 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.71 
 
 		 478 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  51.16 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  53.08 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  51.41 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  51.41 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  53.08 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.95 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  51.41 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.15 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.71 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  54.67 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.73 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.88 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  52.33 
 
 		 473 aa  371  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  54.59 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  55.52 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.87 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  51.2 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  50.67 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  53.8 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  52.97 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.3 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.89 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  50.62 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  52.76 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  54.35 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  51.6 
 
 		 414 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.54 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  53.47 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  51.6 
 
 		 414 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.78 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  56.33 
 
 		 473 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  54.01 
 
 		 412 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.54 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  50.53 
 
 		 409 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  50.53 
 
 		 409 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  51.35 
 
 		 401 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  53.48 
 
 		 412 aa  363  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  52.79 
 
 		 390 aa  363  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1560  NADP-dependent malic enzyme  51.79 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00518562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  53.48 
 
 		 412 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  52.34 
 
 		 391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.35 
 
 		 460 aa  361  9e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  53.21 
 
 		 412 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  53.21 
 
 		 412 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  53.21 
 
 		 412 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  53.21 
 
 		 412 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  53.21 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  53.21 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  53.21 
 
 		 412 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.21 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  51.07 
 
 		 414 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  53.11 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.82 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  52.51 
 
 		 461 aa  359  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  53.72 
 
 		 466 aa  358  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.41 
 
 		 492 aa  359  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  53.21 
 
 		 412 aa  359  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  47.56 
 
 		 754 aa  359  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.56 
 
 		 476 aa  358  8e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.87 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  51.93 
 
 		 469 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  54.96 
 
 		 477 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.31 
 
 		 463 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  52.79 
 
 		 462 aa  355  7.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  51.12 
 
 		 427 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.99 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  56.32 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.93 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3529  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.81 
 
 		 462 aa  352  5e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  50.99 
 
 		 411 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>