More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22060  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 		 312 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2236  aldo/keto reductase  62.34 
 
 		 304 aa  352  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1104  aldo/keto reductase  55.1 
 
 		 329 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2974  aldo/keto reductase  55.77 
 
 		 334 aa  308  9e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118677  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2955  aldo/keto reductase  52.09 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3196  aldo/keto reductase  52.56 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1756  aldo/keto reductase  53.21 
 
 		 325 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3096  aldo/keto reductase  51.27 
 
 		 327 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0474287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1925  aldo/keto reductase  51.11 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251191  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3291  aldo/keto reductase  50.96 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.343705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7472  aldo/keto reductase  53.85 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0134  aldo/keto reductase  47.59 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165242  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1947  oxidoreductase  38.36 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.561644  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  26.03 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  34.03 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  29.39 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  28.12 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2284  aldo/keto reductase  25.4 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3275  putative aldo-keto reductase  26.45 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  28.16 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4101  putative aldo-keto reductase  26.77 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000408733  hitchhiker  0.00103859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02682  predicted oxidoreductase, NADP(H)-dependent aldo-keto reductase  26.77 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0856  aldo/keto reductase  26.77 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00288116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02643  hypothetical protein  26.77 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  29.06 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1257  aldo/keto reductase  23.42 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  26.45 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1638  aldo/keto reductase  27.36 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336172 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  26.45 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.34 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2981  putative aldo-keto reductase  26.45 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  31.23 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2982  putative aldo-keto reductase  26.45 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0288207  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3028  putative aldo-keto reductase  26.77 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  28.97 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  27.24 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  27.74 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  27.82 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  28.94 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  34.75 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  29.73 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0736  aldo/keto reductase  23.51 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  23.55 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  28.99 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  24.92 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3336  putative aldo-keto reductase  25.08 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  0.0101445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3221  putative aldo-keto reductase  25.08 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  hitchhiker  0.000238185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3173  putative aldo-keto reductase  25.08 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.981924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3155  putative aldo-keto reductase  25.08 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0659763  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3236  putative aldo-keto reductase  25.08 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0896684  hitchhiker  0.000000643826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1648  aldo/keto reductase  27.53 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  25.08 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  26.91 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0743  aldo/keto reductase  25.07 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357174  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3126  aldo/keto reductase  23.55 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3379  aldo/keto reductase  23.38 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.27 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0900  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.16 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  30.58 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  25.63 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0747  aldo/keto reductase  23.05 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  27.86 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  25.4 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3273  aldo/keto reductase  23.05 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0511  aldo/keto reductase  22.5 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  25 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1316  aldo/keto reductase  24.92 
 
 		 352 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  23.42 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  28.92 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4410  aldo/keto reductase  24.56 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.332653  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1055  aldo/keto reductase  25.56 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  27.31 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  26.89 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  24.1 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0900  aldo/keto reductase  24.64 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.933192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  24.27 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  29.61 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  29.63 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  32.95 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  25.56 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  27.42 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  26.28 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0830  aldo/keto reductase  22.15 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  28.99 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  27.42 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  25.43 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.94 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3708  aldo/keto reductase  23.96 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.94 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3022  putative aldo-keto reductase  24.27 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0156973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  26.17 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  25.39 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  25.39 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  22.94 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4538  aldo/keto reductase  25.23 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.835863  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  26.91 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  27.34 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1484  aldo/keto reductase  25.55 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  25.83 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>