More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0047 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0045  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0753  tRNA-Met  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0540995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0026  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.71 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  89.71 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.71 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  89.71 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  89.71 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.71 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.71 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  89.71 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA11  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0021    89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.24709  hitchhiker  0.00028661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0046  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0056  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0027  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0057  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0045  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  89.71 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0019  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-3  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.390156  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0046  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6011  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.991195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0009  tRNA-Met  95.56 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-3  tRNA-Met  88.24 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000174152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-3  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000104946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  88.24 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  88.24 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  88.24 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  88.24 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t027  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t028  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0004  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000171027  normal  0.958978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0074  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142028  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0032  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0076  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000117195  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0056  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0057  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0058  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>