More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1212 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1212  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 466 aa  966    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0872595  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1054  cysteinyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 		 466 aa  568  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0579  cysteinyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.717653  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1142  cysteinyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0116  cysteinyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0788  cysteinyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 459 aa  498  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0413015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1208  cysteinyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0823  cysteinyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.449834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0893  cysteinyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0630  cysteinyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.347477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  41.06 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 490 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 482 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 493 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 481 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 456 aa  362  6e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 460 aa  362  8e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 468 aa  360  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 481 aa  360  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 464 aa  359  8e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 485 aa  358  9e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 461 aa  358  9e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 459 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 461 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 466 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 461 aa  356  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 461 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 483 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 461 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 461 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 463 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 468 aa  353  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 460 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 459 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 459 aa  352  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 480 aa  352  7e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 461 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 463 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 493 aa  350  4e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 459 aa  349  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1983  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 465 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746601  normal  0.57879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 462 aa  348  8e-95  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 463 aa  349  8e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 465 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5384  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 465 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706062  normal  0.64461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  40.47 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 472 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 465 aa  347  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2097  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 465 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.466573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 461 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 461 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>