131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4214 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4214  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4647  hypothetical protein  80.59 
 
 
187 aa  283  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00553869  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1161  putative acetyltransferase  45.93 
 
 
183 aa  151  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2452  acetyltransferase  43.64 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.765579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4701  hypothetical protein  42.28 
 
 
172 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3181  hypothetical protein  41.78 
 
 
174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2638  acetyltransferase, putative  40.94 
 
 
176 aa  137  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.77086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1120  acetyltransferase, putative  40 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.262242  normal  0.137241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1575  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6273  putative N-acetyltransferase (GCN5-related)  34.81 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112856  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5405  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.427445  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0839  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0880466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248347  normal  0.0288305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1904  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
204 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3485  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143784  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1154  hypothetical protein  28.47 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  32.42 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776348  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
186 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2524  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1022  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
197 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1041  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
196 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938942  normal  0.5061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1744  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2385  acetyltransferase, GNAT family  32.84 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1465  acetyltransferase  30.14 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3328  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365635  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4769  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  38.21 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.18307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4143  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2743  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
199 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2204  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
199 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1214  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00447272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755062  normal  0.374224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1590  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2118  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.109403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3936  acetyltransferase  24.42 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.229925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1220  hypothetical protein  34.13 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351729  normal  0.46007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0863  hypothetical protein  31.82 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106514  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1851  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0859  hypothetical protein  32.21 
 
 
198 aa  51.2  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.5826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0928  hypothetical protein  31.17 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0129242  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  30.89 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2042  acetyltransferase  25.78 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  26.49 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2094  GCN5-related N-acetyltransferase  44.74 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404304  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21710  hypothetical protein  30.22 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  37.35 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0955169  normal  0.362531 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1121  acetyltransferase, GNAT family  35.9 
 
 
131 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.411224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4742  acetyltransferase, GNAT family  28.97 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4468  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2475  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0323  hypothetical protein  25.17 
 
 
212 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1092  putative amino-acid acetyltransferase  32.85 
 
 
199 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.981692  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1811  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3059  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2139  acetyltransferase, GNAT family  29.41 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0496  ribosomal protein N-acetylase-like protein  27.13 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.263898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
236 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1895  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
198 aa  48.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
197 aa  47.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3097  acetyltransferase, GNAT family  29.91 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2919  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1090  hypothetical protein  32.98 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.914734  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2491  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.927316  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3969  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
200 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1594  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
200 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
200 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.598769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2883  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
195 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2725  amino-acid acetyltransferase  27.93 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0306  hypothetical protein  24.49 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0622  hypothetical protein  28 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2881  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
176 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457106  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2941  acetyltransferase, GNAT family  31.3 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6315  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2891  acetyltransferase  28.57 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0153318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3108  acetyltransferase  28.57 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2355  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4069  hypothetical protein  37.8 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0997  hypothetical protein  29.38 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121835  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2820  acetyltransferase  28.57 
 
 
195 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3953  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
201 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
181 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3130  acetyltransferase, GNAT family  30.59 
 
 
195 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157226  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  45.9 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>