30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3627 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  302  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  92.72 
 
 		 151 aa  282  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  57.14 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  42.55 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  41.18 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  45.22 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  37.1 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  32.14 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  38.58 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  43.33 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  44.83 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  40.16 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  39.84 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  32 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  34.33 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  34.78 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  29.23 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  36.36 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19110  Protein of unknown function (DUF2550)  37.61 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11339  hypothetical protein  39.56 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  35.87 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.691478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3948  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000500606  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00794902  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4326  hypothetical protein  38.46 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2320  hypothetical protein  34.69 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1772  hypothetical protein  25.76 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2446  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10050  Protein of unknown function (DUF2550)  32.67 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>