More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3058 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 		 492 aa  989    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  88.62 
 
 		 492 aa  886    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  65.43 
 
 		 501 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  57.02 
 
 		 510 aa  494  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  56.24 
 
 		 480 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  53.92 
 
 		 627 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  54.19 
 
 		 539 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  51.37 
 
 		 479 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  52.29 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  53 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  49.5 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  48.36 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  50.21 
 
 		 517 aa  415  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  47.44 
 
 		 530 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  48.89 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  49.39 
 
 		 522 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  49.8 
 
 		 513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  48.95 
 
 		 500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  49.16 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  47.57 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  50.34 
 
 		 532 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  43.83 
 
 		 531 aa  386  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  49.17 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  48.12 
 
 		 521 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  46.31 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  41.82 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  44.49 
 
 		 453 aa  349  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  35.06 
 
 		 441 aa  240  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  35.4 
 
 		 439 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  35.59 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  33.26 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  36.67 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  33.92 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  36.04 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  36.04 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  33.7 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  33.41 
 
 		 439 aa  224  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  37.04 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  34.78 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  34.78 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  34.38 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  34.57 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  34.57 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  32.89 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  34.35 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  33.77 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  33.55 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  34.88 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  34.44 
 
 		 441 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  34.97 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  35.12 
 
 		 437 aa  217  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  35.12 
 
 		 437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  35.12 
 
 		 437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  35.29 
 
 		 449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  33.77 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  34.67 
 
 		 444 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  34.9 
 
 		 444 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  32.31 
 
 		 436 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  31.91 
 
 		 439 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  34.16 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  34.15 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  37.09 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  33.48 
 
 		 444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  33.26 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  33.48 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  33.48 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  33.48 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  33.41 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  33.26 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  33.26 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  33.48 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  34.17 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  33.26 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  33.48 
 
 		 441 aa  212  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  34.42 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  34.64 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  34.56 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  35.03 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  34.61 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  33.18 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  35.51 
 
 		 461 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  34.77 
 
 		 444 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  36 
 
 		 441 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  34.66 
 
 		 443 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  37.65 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  33.33 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  35.59 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  35.59 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  35.59 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  36.91 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  38.34 
 
 		 446 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  34.29 
 
 		 445 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  35.36 
 
 		 474 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  36.94 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  37.81 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  31.85 
 
 		 437 aa  205  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  35.57 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  34.34 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  34.88 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  34.08 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>