24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2552 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2552  periplasmic binding protein  100 
 
 		 343 aa  688    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2741  periplasmic binding protein  92.13 
 
 		 343 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100238  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4297  periplasmic binding protein  61.76 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000180062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1624  periplasmic binding protein  45.59 
 
 		 338 aa  292  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.29 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3141  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.3 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000696351  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.42 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  30.16 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.25 
 
 		 305 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.25 
 
 		 305 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.25 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.25 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  24.25 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.25 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.25 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.25 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.92 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  33.01 
 
 		 682 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0330  periplasmic binding protein  23.41 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46929  predicted protein  24.3 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  30.73 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20820  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.52 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.017194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.92 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>