48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2302 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  44.85 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  38.83 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  38.31 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  41.08 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  37.43 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  37.16 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  36.76 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  34.39 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  35.62 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  33.95 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  33.16 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.6 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.16 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  29.35 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  32.16 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  35.86 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  37.01 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  32.58 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  33.14 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  29.95 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  20.97 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  20.97 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  29.7 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  22.35 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  24.55 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 472 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 317 aa  42.4  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  45.07 
 
 		 120 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  41.77 
 
 		 227 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 102 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>