More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1021 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  100 
 
 		 425 aa  867    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3425  cytochrome P450  48.74 
 
 		 421 aa  398  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  44.76 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  37.47 
 
 		 412 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4553  cytochrome P450  37.75 
 
 		 404 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174977  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  38.57 
 
 		 414 aa  253  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  34.13 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  35.44 
 
 		 406 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4494  cytochrome P450  36.59 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  37.25 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  34.31 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  34.31 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  34.31 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  34.52 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  34 
 
 		 418 aa  230  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  35.09 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  35.09 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  35.09 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3420  cytochrome P450  34.34 
 
 		 406 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00557634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  33.67 
 
 		 412 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  32.76 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  32.5 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  34.62 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  32.85 
 
 		 418 aa  227  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  33.17 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  34.7 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  36.2 
 
 		 417 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  32.66 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  33.49 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  32.17 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  32.47 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  31.44 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  33.97 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  34.24 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  34.75 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  31.02 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  32.2 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  32.46 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  33.09 
 
 		 420 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  33.09 
 
 		 420 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  34.24 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  34.24 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  35 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  32.84 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  33.42 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  32.72 
 
 		 427 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  32.72 
 
 		 427 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  32.72 
 
 		 427 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  32.37 
 
 		 424 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  33.75 
 
 		 430 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  34.83 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  30.42 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  32.29 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  32.99 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  30.62 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  31.93 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  31.93 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  31.93 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  32.61 
 
 		 420 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  32.64 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  31.93 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  33.33 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  33.01 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  31.28 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  33.42 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  32.13 
 
 		 408 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  32.2 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.51 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2967  cytochrome P450  33.33 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  30.25 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3974  cytochrome P450  30.94 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  31.99 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  31 
 
 		 423 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  31 
 
 		 423 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  34.24 
 
 		 402 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  34.24 
 
 		 402 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  32.51 
 
 		 415 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  32.33 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  33.33 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  33.09 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  33.99 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  31.43 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  31.28 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  31.59 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  32.78 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  30.5 
 
 		 423 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  31.43 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  31.43 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  31.75 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  33.51 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3992  hypothetical protein  34.78 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  32.82 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  32.05 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  31.37 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.73 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  29.53 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.08 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3162  cytochrome P450  30.17 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  30.05 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  30 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>