More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0434 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  82.99 
 
 
729 aa  1138    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  100 
 
 
731 aa  1450    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1960  teichoic acid biosynthesis protein F  25.43 
 
 
721 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  38.94 
 
 
1157 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  37.64 
 
 
1148 aa  200  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  34.93 
 
 
941 aa  183  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.59 
 
 
1168 aa  181  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0637  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  39.94 
 
 
965 aa  180  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0245  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.81 
 
 
389 aa  178  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0239  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.81 
 
 
389 aa  178  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8378  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  35.49 
 
 
931 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1280  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  34.85 
 
 
372 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  38.84 
 
 
1173 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0301  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.53 
 
 
390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3986  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  35 
 
 
358 aa  162  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  31.68 
 
 
1169 aa  161  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1574  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  35.08 
 
 
404 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178333  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0738  CDP-glycerol glycerophosphotransferase  35.6 
 
 
1229 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299201  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  36.46 
 
 
946 aa  156  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14710  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  29.47 
 
 
434 aa  147  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2975  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.69 
 
 
965 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.381876  normal  0.374774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2178  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.88 
 
 
952 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41462  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
1116 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  39.45 
 
 
341 aa  134  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase, putative  27.81 
 
 
1098 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.048897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1210  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  30.93 
 
 
946 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255767  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
329 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27880  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  32.09 
 
 
1269 aa  124  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.893451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  38.39 
 
 
616 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
324 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
335 aa  122  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
856 aa  120  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27900  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  36.58 
 
 
1157 aa  120  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.67 
 
 
970 aa  118  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
553 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
348 aa  115  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  35.05 
 
 
785 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  28.76 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
366 aa  112  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.08 
 
 
325 aa  112  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.39 
 
 
326 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
333 aa  110  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0738  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
319 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0554497  hitchhiker  0.00271528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
355 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3544  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.83 
 
 
395 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  27.8 
 
 
353 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.25 
 
 
350 aa  105  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
358 aa  105  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.02 
 
 
329 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
334 aa  104  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.02 
 
 
329 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  27.08 
 
 
325 aa  103  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
342 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0456  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 
370 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.9 
 
 
328 aa  101  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 
351 aa  101  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
334 aa  101  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.11 
 
 
326 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.81 
 
 
326 aa  101  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  30.04 
 
 
321 aa  101  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
346 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
348 aa  100  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
341 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  29.77 
 
 
332 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2081  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
520 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312551  normal  0.0895678 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  34.5 
 
 
349 aa  99.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
321 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  30.8 
 
 
327 aa  99  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
369 aa  98.6  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  27.8 
 
 
326 aa  98.2  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.38 
 
 
326 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
343 aa  97.8  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  31.02 
 
 
334 aa  97.4  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.02 
 
 
334 aa  97.4  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
326 aa  97.4  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.53 
 
 
326 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
340 aa  97.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  40.52 
 
 
697 aa  96.3  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  26.03 
 
 
333 aa  95.9  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2336  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
806 aa  95.5  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  28.89 
 
 
341 aa  95.1  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  37.5 
 
 
301 aa  94.7  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  34.06 
 
 
327 aa  94.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  31.31 
 
 
344 aa  94.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
313 aa  94  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  30.84 
 
 
344 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2557  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
354 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  38.6 
 
 
391 aa  93.6  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
289 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  31.31 
 
 
344 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1571  cell wall membrane glycosyltransferase  42.48 
 
 
439 aa  92.8  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.804132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27860  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  28.45 
 
 
546 aa  92.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  31.31 
 
 
344 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  31.31 
 
 
344 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
351 aa  92.8  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
329 aa  93.2  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.66 
 
 
322 aa  92  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
323 aa  92  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>