29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2870 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 69 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 69 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 72 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0086  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.417163  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1336  hypothetical protein  35.71 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.94784  normal  0.842689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  29.41 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  29.41 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  30.16 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1322  hypothetical protein  30.14 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117292  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2853  putative transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  29.23 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  25.76 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 80 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>