27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2246 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2246  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 442 aa  861    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1447  amino acid permease-associated region  46.06 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2139  amino acid permease-associated region  39.54 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.578825  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1373  amino acid permease-associated region  37.75 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0348286 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0964  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 463 aa  190  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.801487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 450 aa  54.3  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 		 485 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  26.12 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 		 450 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.04 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  22.6 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.12 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  24.26 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.84 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.91 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  22.54 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.06 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  21.67 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>