32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2139 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2139  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 417 aa  800    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.578825  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2246  amino acid permease-associated region  39.54 
 
 		 442 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  38.97 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1447  amino acid permease-associated region  37.35 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1373  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 		 484 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0348286 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0964  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.801487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 443 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  23.83 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 466 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  22.99 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  22.75 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  22.71 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  21.28 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  22.47 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  21 
 
 		 526 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0588  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.894374  normal  0.71791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  24.35 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  21.8 
 
 		 481 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  22.6 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>