48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0194 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  100 
 
 
351 aa  704    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  59.38 
 
 
357 aa  441  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  40.72 
 
 
380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  40.63 
 
 
377 aa  238  9e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  38.52 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  38.01 
 
 
389 aa  223  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  38.72 
 
 
387 aa  203  3e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  39.23 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  34.96 
 
 
324 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  31.87 
 
 
328 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  33.78 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  30.46 
 
 
329 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  30.68 
 
 
369 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  31.06 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  30.27 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  30.71 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  31.18 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  30.54 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  31.25 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.34 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  28.34 
 
 
367 aa  123  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  27.17 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  28.8 
 
 
369 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  28.42 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  28.8 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  28.07 
 
 
369 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  28.26 
 
 
369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  26.52 
 
 
364 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  27.02 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  29.86 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  27.71 
 
 
346 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  28.65 
 
 
374 aa  106  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  28.25 
 
 
370 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  25.14 
 
 
369 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  27.2 
 
 
368 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  26.67 
 
 
407 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  26.84 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  27.42 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  27.4 
 
 
365 aa  97.1  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  25.71 
 
 
370 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  26.77 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  25.34 
 
 
367 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  26.84 
 
 
410 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  26.37 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  22.76 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  40 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  34.48 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  32.93 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>