34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2703 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  356  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  84.12 
 
 		 184 aa  296  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  60.34 
 
 		 180 aa  223  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  58.38 
 
 		 171 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  40.7 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  38.18 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  35.03 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  36.53 
 
 		 190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  36.75 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  35.15 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  34.55 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  34.57 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  31.74 
 
 		 168 aa  84.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  28.37 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  40.62 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  31.76 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 429 aa  58.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  27.82 
 
 		 188 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  36.71 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  35.37 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  34.52 
 
 		 89 aa  47.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  40.91 
 
 		 251 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  31.11 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  36.73 
 
 		 254 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  36.73 
 
 		 254 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  31.76 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>