19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2264 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  100 
 
 		 374 aa  786    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2239  HNH nuclease  66.76 
 
 		 353 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2120  HNH nuclease  66.48 
 
 		 353 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.459779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2106  HNH nuclease  66.48 
 
 		 353 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.63229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2355  HNH nuclease  65.93 
 
 		 353 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4564  HNH nuclease  36.8 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1005  HNH nuclease  39.04 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4871  HNH nuclease  34.43 
 
 		 353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  34.1 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1208  HNH nuclease  34.79 
 
 		 352 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  27.41 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  27.07 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0924  hypothetical protein  35.62 
 
 		 315 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  37.08 
 
 		 1395 aa  46.6  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  36.21 
 
 		 586 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0036  HNH endonuclease  24.85 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  42 
 
 		 585 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 151 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 146 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>