25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0755 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0755  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  518  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.684175  hitchhiker  0.00000180736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2142  hypothetical protein  31.58 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.532898  normal  0.0656443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2141  hypothetical protein  32.65 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0962248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2144  hypothetical protein  29 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.389277  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0526  hypothetical protein  31.84 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3578  LuxR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4008  LuxR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0690  LuxR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4624  LuxR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4197  response regulator receiver protein  22.39 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4329  LuxR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2457  hypothetical protein  28.78 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.418113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2091  hypothetical protein  40.85 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0353766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3799  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1969  hypothetical protein  28.91 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1731  hypothetical protein  30.67 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2699  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1733  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  47.5 
 
 		 681 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2116  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5911  putative oxidoreductase  27.54 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3996  hypothetical protein  40.98 
 
 		 185 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.41061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  31.4 
 
 		 861 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>