17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9307 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  27.08 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  27.75 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  22.13 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  27.89 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  27.85 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  24.87 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  22.49 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  26.34 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  21.91 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  26.47 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  23.71 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  23.5 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  18.78 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  21.26 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  22.08 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  23.91 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>