32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7393 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  32.58 
 
 
270 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  34.35 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5525  hypothetical protein  35.23 
 
 
262 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  33.71 
 
 
273 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.16 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  22.99 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  23.42 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2772  putative ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.1 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  24.11 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  21.64 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  20 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  19.78 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1838  hypothetical protein  27.01 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.32 
 
 
542 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  19.4 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  19.64 
 
 
259 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  19.4 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  19.4 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  22.98 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1773  hypothetical protein  23.79 
 
 
546 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  25 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  25.84 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  26.91 
 
 
542 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  26.91 
 
 
542 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4246  hypothetical protein  34.15 
 
 
266 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2984  hypothetical protein  26.83 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3386  hypothetical protein  22.71 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0545233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2170  ABC transporter, permease component  22.59 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  20.98 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>