27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7331 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  63.9 
 
 
290 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  52.99 
 
 
274 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  45.24 
 
 
275 aa  208  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  45.11 
 
 
270 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  28.85 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  29.48 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  33.01 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  27.44 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  34.27 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  30.41 
 
 
467 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  25.51 
 
 
429 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  27.1 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  25.88 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  26.19 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  26.19 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  26.19 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  26.28 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  32.86 
 
 
288 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  37.68 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  38.18 
 
 
341 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  29.73 
 
 
212 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  28 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  26.11 
 
 
321 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>