50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7160 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  65.81 
 
 		 157 aa  210  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  36.18 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  36.18 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  30.34 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  28.97 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  28.66 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  32.06 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  36.92 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  28.03 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  28.97 
 
 		 159 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  28.97 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  29.3 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  28.97 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  26.11 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  28.1 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  27.56 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  29.03 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  29.05 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  33.55 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  27.07 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  27.46 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  28.97 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  27.46 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  29.86 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  25.87 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  28.67 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  27.59 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  30.34 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  28 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  25.17 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  25.16 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  24.48 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  25.17 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  23.84 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  26.53 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  30.38 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  26.67 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  28.48 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  26.06 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  30.57 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  26.35 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  21.38 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  22.3 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  27.01 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  29.7 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0423  hypothetical protein  23.4 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  28.05 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>