24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4587 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4587  protease, CAAX amino terminal family  100 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000987036  normal  0.0574334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3280  abortive infection protein  51.13 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0291  Abortive infection protein  34.78 
 
 		 567 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621613  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  38.26 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  25.96 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3583  abortive infection protein  40.16 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  39.22 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  36.63 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  26.47 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  34.58 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  31.33 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  30.84 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  30.84 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  30.84 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  26.92 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  26.92 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  26.92 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  26.92 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  26.92 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2896  Abortive infection protein  33.02 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.142954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  38.95 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  26 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2821  Abortive infection protein  36.36 
 
 		 340 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0859  Abortive infection protein  37.33 
 
 		 375 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>