15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3576 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3576  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  534  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4354  hypothetical protein  70 
 
 
152 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  39.59 
 
 
223 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  36.09 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  37.31 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  42.74 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  37.58 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  23.44 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  28 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  27.15 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5590  hypothetical protein  32.38 
 
 
240 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.76216  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5418  hypothetical protein  32.38 
 
 
240 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.652513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  33.15 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>