32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2604 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  91.43 
 
 		 210 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  90.95 
 
 		 210 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  90.95 
 
 		 210 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  90.48 
 
 		 210 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  85.24 
 
 		 210 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  85.24 
 
 		 210 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  84.76 
 
 		 210 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  82.38 
 
 		 210 aa  361  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  52.4 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  55.73 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  57.14 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  49.21 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  47.19 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  48.19 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  46.37 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  30.67 
 
 		 254 aa  88.2  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  24.12 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  27.33 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  27.33 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  31.69 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  28.24 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  25.79 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  25.17 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  22.88 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  22.86 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  21.47 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  23.85 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  25.64 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>