21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1743 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1743  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  593  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1881  hypothetical protein  80.84 
 
 
287 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000377612  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2444  hypothetical protein  80.49 
 
 
287 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1833  hypothetical protein  80.14 
 
 
287 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000548981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1847  hypothetical protein  80.49 
 
 
287 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00110245  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2273  hypothetical protein  81.34 
 
 
307 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.308758  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2196  hypothetical protein  81.34 
 
 
307 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2406  hypothetical protein  80.99 
 
 
307 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23744  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2199  hypothetical protein  76.87 
 
 
291 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2000  hypothetical protein  55.56 
 
 
286 aa  360  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000240648  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1585  hypothetical protein  60.22 
 
 
299 aa  359  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2641  hypothetical protein  53.82 
 
 
293 aa  338  9e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.332337  normal  0.0619929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1988  hypothetical protein  52.61 
 
 
297 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2513  hypothetical protein  52.43 
 
 
290 aa  325  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2311  hypothetical protein  51.02 
 
 
290 aa  324  9e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.141718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1480  hypothetical protein  49.07 
 
 
303 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1340  hypothetical protein  39.37 
 
 
295 aa  221  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00430506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1235  hypothetical protein  37.54 
 
 
299 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110146  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06646  hypothetical protein  36.79 
 
 
278 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4325  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3519  hypothetical protein  19.4 
 
 
272 aa  49.3  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>