22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2444 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2444  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1847  hypothetical protein  99.65 
 
 
287 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00110245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1881  hypothetical protein  99.65 
 
 
287 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000377612  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1833  hypothetical protein  98.95 
 
 
287 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000548981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2196  hypothetical protein  83.62 
 
 
307 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2273  hypothetical protein  83.62 
 
 
307 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.308758  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2406  hypothetical protein  82.93 
 
 
307 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23744  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1743  hypothetical protein  80.49 
 
 
287 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2199  hypothetical protein  75.87 
 
 
291 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1585  hypothetical protein  60.95 
 
 
299 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2000  hypothetical protein  57.09 
 
 
286 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000240648  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1988  hypothetical protein  54.76 
 
 
297 aa  350  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2513  hypothetical protein  55.71 
 
 
290 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2641  hypothetical protein  51.72 
 
 
293 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.332337  normal  0.0619929 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2311  hypothetical protein  51.37 
 
 
290 aa  317  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.141718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1480  hypothetical protein  50.74 
 
 
303 aa  300  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1340  hypothetical protein  40.14 
 
 
295 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00430506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1235  hypothetical protein  40 
 
 
299 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110146  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06646  hypothetical protein  37.19 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4325  hypothetical protein  26.59 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3519  hypothetical protein  21.32 
 
 
272 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03105  hypothetical protein  20.51 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>