22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1585 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1585  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1988  hypothetical protein  66.67 
 
 
297 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2641  hypothetical protein  66.54 
 
 
293 aa  401  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.332337  normal  0.0619929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2196  hypothetical protein  61.9 
 
 
307 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2273  hypothetical protein  61.9 
 
 
307 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.308758  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1847  hypothetical protein  60.95 
 
 
287 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00110245  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1833  hypothetical protein  60.95 
 
 
287 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000548981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2444  hypothetical protein  60.95 
 
 
287 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2406  hypothetical protein  61.54 
 
 
307 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23744  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1881  hypothetical protein  60.95 
 
 
287 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000377612  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2513  hypothetical protein  61.23 
 
 
290 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1743  hypothetical protein  60.22 
 
 
287 aa  359  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2199  hypothetical protein  56.93 
 
 
291 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2000  hypothetical protein  58.11 
 
 
286 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000240648  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2311  hypothetical protein  47.3 
 
 
290 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.141718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1480  hypothetical protein  46.89 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1340  hypothetical protein  41.26 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00430506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1235  hypothetical protein  39.53 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110146  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06646  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4325  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3519  hypothetical protein  23.48 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03105  hypothetical protein  23.97 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>