39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0663 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  95.56 
 
 		 360 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  95.56 
 
 		 360 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  96.39 
 
 		 360 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 360 aa  719    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  96.67 
 
 		 360 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  85.15 
 
 		 364 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  84.87 
 
 		 364 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  35.51 
 
 		 361 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  36.22 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  40.34 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  34.83 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  34.71 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  34.71 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.71 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  35.41 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.44 
 
 		 340 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.44 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  35.68 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  34.22 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.17 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  29.26 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  28.34 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  30.41 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  26.22 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  25.65 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  28.8 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  28.96 
 
 		 304 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  27.92 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  27.17 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  29.05 
 
 		 331 aa  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  27.14 
 
 		 314 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  24.21 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  25.79 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  26.6 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  25.26 
 
 		 347 aa  46.2  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  27.72 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.83 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  21.49 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  22.83 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>