More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3229 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 313 aa  634    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  92.95 
 
 		 312 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  92.63 
 
 		 312 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  94.87 
 
 		 312 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  94.87 
 
 		 312 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  94.87 
 
 		 312 aa  587  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 		 312 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  91.99 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  91.67 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  91.67 
 
 		 312 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  91.67 
 
 		 312 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  91.67 
 
 		 312 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  91.67 
 
 		 312 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  91.67 
 
 		 312 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  91.67 
 
 		 312 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  90.71 
 
 		 312 aa  567  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  89.74 
 
 		 312 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  47.92 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  47.4 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  46.43 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  46.41 
 
 		 315 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  46.28 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  43.55 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  45.13 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  45.02 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  45.9 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  44.19 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  46.56 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  45.9 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  42.58 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  44.84 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  39.93 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  41.77 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  45.49 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  38.64 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  40 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  42.71 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  38.96 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  41.95 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  45.66 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  40.42 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  43.23 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  35.18 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  43.23 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  36.19 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  31.96 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  37.37 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.21 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.92 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  36.13 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.01 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  32.46 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  38.04 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  31.16 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  36.43 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  34.38 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  27.87 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  34.38 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  29.51 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.9 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  33.68 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  32.82 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  34.87 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.84 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  31.6 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  34.98 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  31.6 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  29.3 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.58 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  32.82 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  31.94 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  31.68 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  35.58 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>