81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2746 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  335  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  74.39 
 
 		 164 aa  261  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  74.1 
 
 		 166 aa  255  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  74.07 
 
 		 165 aa  253  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.88 
 
 		 166 aa  237  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  67.88 
 
 		 166 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  67.88 
 
 		 166 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  67.27 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.48 
 
 		 166 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.48 
 
 		 166 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.48 
 
 		 166 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  68.48 
 
 		 166 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  68.86 
 
 		 166 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  66.67 
 
 		 166 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.06 
 
 		 168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2585  amino acid-binding ACT  65.45 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  35.4 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  36.65 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.33 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  35.4 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  34.16 
 
 		 180 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  34.16 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.65 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  34.55 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.4 
 
 		 172 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.02 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.68 
 
 		 172 aa  97.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  36.02 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  31.29 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  26.99 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  32.3 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  30.91 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  32.54 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.78 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.95 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  31.25 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.18 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  27.98 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  29.52 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.86 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.57 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2546  hypothetical protein  24.68 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  25.31 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2884  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  23.6 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  27.08 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3675  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  20.75 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  23.39 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.91 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  30.4 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3434  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  22.78 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  27.01 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  26.45 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0869  hypothetical protein  27.46 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00598997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  23.9 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003104  glycine cleavage system regulatory protein  23.12 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00303201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.85 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.25 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02738  hypothetical protein  21.88 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3623  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  23.29 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3629  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  18.87 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.82 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  23.24 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  25.4 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.4 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.2 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1510  amino acid-binding ACT domain protein  27.96 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0143098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00127  glycine cleavage system transcriptional repressor  23.31 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0355979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  23.53 
 
 		 173 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  23.53 
 
 		 173 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.5 
 
 		 165 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2611  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.06 
 
 		 212 aa  40.8  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2851  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.06 
 
 		 212 aa  40.8  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2761  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.06 
 
 		 212 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3701  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.06 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1190  amino acid-binding ACT domain protein  26.06 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02333  hypothetical protein  26.06 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2626  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.06 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1197  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.06 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02371  DNA-binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA  26.06 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  27.38 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>