31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1333 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  426  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  59.79 
 
 
208 aa  242  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  55.96 
 
 
208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  53.37 
 
 
210 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  50.72 
 
 
210 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  52.88 
 
 
210 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  52.4 
 
 
210 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  52.88 
 
 
210 aa  228  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  52.4 
 
 
210 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  50.96 
 
 
210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  50.48 
 
 
210 aa  224  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  50.48 
 
 
210 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  56.7 
 
 
208 aa  215  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  46.4 
 
 
237 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  50 
 
 
236 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  43.18 
 
 
210 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  30.91 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  28.28 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  31.65 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  31.01 
 
 
212 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  26.32 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  29.63 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  34.26 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  31.25 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  29.2 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  28.06 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  23.2 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  25 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  26.28 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  26.4 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  24.14 
 
 
185 aa  41.6  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>