21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1218 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  75.26 
 
 		 195 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  75.13 
 
 		 195 aa  294  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  78.31 
 
 		 189 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  61.36 
 
 		 192 aa  221  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  56.68 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  32.62 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  31.49 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  32.08 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  30.82 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  32.17 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  31.41 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  30.06 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  30.06 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  30.06 
 
 		 194 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  30.06 
 
 		 194 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  30.06 
 
 		 194 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  30.06 
 
 		 194 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  30.06 
 
 		 194 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>