22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2688 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2688  Methyltransferase type 12  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1034  Methyltransferase type 12  32.34 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00209659  normal  0.0192304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8636  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
560 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2343  Methyltransferase type 12  27.53 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  29.06 
 
 
575 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1328  Methyltransferase type 12  28.93 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  34 
 
 
200 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  32.38 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  29.52 
 
 
2997 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  28.23 
 
 
535 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  29.92 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  26.5 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  27.94 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1379  hypothetical protein  26.4 
 
 
393 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.64 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  25.36 
 
 
522 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2656  methyltransferase type 12  27.21 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.322619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>