17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0950 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0950  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1082    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.184254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  44.86 
 
 		 357 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  42.17 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5243  hypothetical protein  30.93 
 
 		 353 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  28.16 
 
 		 366 aa  93.6  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1017  hypothetical protein  25.23 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  28.96 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.76 
 
 		 900 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  27.72 
 
 		 620 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  30.59 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  27.97 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  22.47 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 		 1231 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  28.87 
 
 		 490 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  24.01 
 
 		 314 aa  45.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  26.97 
 
 		 519 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  31.76 
 
 		 325 aa  43.5  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>