299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0038 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_R0038  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0035  tRNA-Phe  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0038  tRNA-Phe  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000542826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0063  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135232  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0024  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0036  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000108389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0061  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0043  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0067  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000000833232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0269  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0004  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.111017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0002  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00055  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00056658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00079  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0014  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0086  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3366  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557417  normal  0.506535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4739  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4591  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.441265  normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t60  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3461  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0037  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3358  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4281  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3111  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0206196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4698  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0016  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0448641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0073  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.824805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA76  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0079  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R9  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0021  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811173  normal  0.0253412 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0161  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129088 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0083  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0011  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4210  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4599  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4717  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0101  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4271  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4682  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3292  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3610  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4603  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000814099  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5068  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4722  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00159768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0071  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.171238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5108  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0091  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.704949  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0064  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0733  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00229797  decreased coverage  0.0082117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0080  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3281  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPhe01  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0594  tRNA-Phe  91.94 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0022  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0047  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0002  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0002  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5650  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000510114  normal  0.526212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0054  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0002  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPhe01  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0059  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0062  tRNA-Phe  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.205549  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4952  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0017  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0010  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0009  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0046  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0051  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0676526  normal  0.132155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0023  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0022  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.688613  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0017  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0087  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0047  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558983  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0102  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t079  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t081  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0020  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000569791  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0085  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0384171  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0100  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000189649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0020  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.963611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0032  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118314  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0045  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0165  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.337836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0102  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000613191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0108  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000869293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0043  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000783978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0112  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0390211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0050  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00823452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0052  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00638125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0121  tRNA-Phe  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000163841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>