16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0452 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  689    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  24.01 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  22.18 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.09 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.02 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  27.12 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.12 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.09 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.04 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.33 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  24.37 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  20.34 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>