More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4796 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 		 499 aa  1008    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  61.31 
 
 		 474 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60.51 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  57.42 
 
 		 481 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  48.83 
 
 		 477 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  48.23 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  44.05 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.35 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  42.95 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.95 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.51 
 
 		 510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.67 
 
 		 499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.23 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.71 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  41.15 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  47.79 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.55 
 
 		 474 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.69 
 
 		 465 aa  316  7e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.37 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.24 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.2 
 
 		 475 aa  307  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  40.5 
 
 		 445 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  39.54 
 
 		 472 aa  299  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  44.94 
 
 		 469 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  39.79 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  40 
 
 		 477 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  38.95 
 
 		 478 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  39.79 
 
 		 477 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  39.58 
 
 		 477 aa  286  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.13 
 
 		 1553 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  27.53 
 
 		 449 aa  124  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  27.85 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  28.21 
 
 		 430 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  28.6 
 
 		 452 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  29.42 
 
 		 447 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  26.71 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.71 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  26.72 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  27.54 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  27.68 
 
 		 451 aa  103  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1578  phosphoglucosamine mutase  27.7 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.840977  normal  0.129452 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  26.28 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  29.74 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  27.68 
 
 		 445 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  30.1 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3596  phosphoglucosamine mutase  27.88 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  29.74 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  29.29 
 
 		 447 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  24.8 
 
 		 453 aa  97.4  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  27.16 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  28.61 
 
 		 483 aa  96.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0810  phosphoglucosamine mutase  28.81 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  26.3 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0030  phosphoglucosamine mutase  26 
 
 		 440 aa  95.1  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000444071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  28.32 
 
 		 496 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  28.32 
 
 		 496 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1095  phosphoglucosamine mutase  26.41 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  25.43 
 
 		 455 aa  95.1  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0721  phosphoglucosamine mutase  28.6 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 		 448 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 		 448 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 		 448 aa  94  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 		 448 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 		 448 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 		 448 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  94  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 		 448 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  26.43 
 
 		 453 aa  93.6  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  27.33 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  25 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  25 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  25.75 
 
 		 448 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  25.89 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02741  phosphotransferase superclass  25.41 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.531675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  26.68 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  28.06 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  25.15 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  28.07 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  28.33 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  25 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.48 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  27.3 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2223  phosphoglucosamine mutase  28.21 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  27.64 
 
 		 444 aa  90.1  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  25.52 
 
 		 452 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  26.5 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01274  phosphoglucosamine mutase  31.37 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  27.11 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3769  phosphoglucosamine mutase  25.84 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00158807  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  24.9 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  27.17 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  25.51 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  26.17 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  26.98 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  25.85 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  28.24 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  30.43 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.22 
 
 		 452 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>