31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3677 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  260  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  57.89 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  46.76 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  62.28 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  66.22 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  64.52 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  67.12 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  63.44 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  61.15 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  66.22 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  59.7 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  60.16 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  47.06 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  48.24 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  43.53 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  46.83 
 
 		 225 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  43.53 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  46.38 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  43.48 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  46.38 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  37.41 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  35.97 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  35.97 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  32.82 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  31.47 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  47.83 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  35.71 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  34.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  45.24 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  39.29 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>