45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3529 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  79.35 
 
 		 424 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  78.59 
 
 		 424 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  100 
 
 		 426 aa  864    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  69.95 
 
 		 425 aa  624  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  65.31 
 
 		 417 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  58.78 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  60.33 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  59.95 
 
 		 422 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  60.77 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  60.19 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  59.71 
 
 		 431 aa  484  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  62.18 
 
 		 422 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  52.25 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  52.09 
 
 		 431 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  55.41 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  56.19 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  56.19 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  56.7 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  52.05 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  55.21 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  54.78 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  50.37 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  52.28 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  52.01 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  53.48 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  53.35 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  49.75 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  51.93 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  51.16 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  40.15 
 
 		 428 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  42.5 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  41.53 
 
 		 480 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  41.41 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  38.85 
 
 		 482 aa  242  9e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  37.81 
 
 		 441 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  37.19 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  40.36 
 
 		 407 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  39.66 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  34.3 
 
 		 410 aa  202  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  21.61 
 
 		 382 aa  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  32.53 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  35.05 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  22.16 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  22.22 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>