22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2218 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  267  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  34.59 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  38.33 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  34.96 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  28 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  33.85 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  32.76 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  34.96 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  31.45 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  32.77 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  31.45 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  30.17 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  26.72 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  26.32 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  27.82 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  25.38 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  24.81 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>