21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1639 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1639  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  737    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1872  hypothetical protein  96.79 
 
 		 374 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.573397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0787  tail fiber protein  31.34 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08310  hypothetical protein  30.45 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314349  hitchhiker  0.0000557295 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3330  hypothetical protein  39.01 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0254985 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3370  hypothetical protein  38.3 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1633  hypothetical protein  38.3 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235606  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2057  hypothetical protein  38.3 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3764  hypothetical protein  37.59 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3629  hypothetical protein  38.3 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2770  tail fiber domain-containing protein  27.67 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00369502  normal  0.0266249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2667  metallophosphoesterase  37.63 
 
 		 1154 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  46.77 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  31.3 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  31.3 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3936  tail fiber domain protein  33.05 
 
 		 332 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10057  Tail fiber  41.43 
 
 		 87 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3533  hypothetical protein  37.62 
 
 		 878 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0263715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1449  hypothetical protein  30.66 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  42.19 
 
 		 264 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00754  hypothetical protein  44.23 
 
 		 68 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>