30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1431 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  54.96 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  65.59 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  63.44 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  57.69 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  51.85 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  57.14 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  56 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  53.33 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  52.59 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  58.27 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  58.27 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  42.53 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  41.38 
 
 		 221 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  40.43 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  36.78 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  37.23 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  44.93 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  46.38 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  45.08 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  46.38 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  31.15 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  38.81 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 		 264 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  32.86 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  27.08 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  32.12 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>